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Der zytologische Befund von epithelialen Thymustumoren ist abhängig vom histologischen Subtyp. Die Einteilung der Thymome nach WHO umfasst die Typen A, AB, B1, B2, B3 und Typ C (Thymuskarzinom). Die Subtypen unterscheiden sich bezüglich Morphologie und Atypiegrad der epithelialen Zellen und in der Menge der beigemischten unreifen T Lymphozyten. Unten gezeigt wird ein Thymom vom Typ A (medulläres Thymom). Die Ausstriche enthalten bei diesem Subtyp monotone Spindelzellen mit feingranulierten Kernen ohne Atypien und nur wenige Lymphozyten. Ein Teil der Spindelzellen kann positiv sein für den B-Zell Marker CD20. Die unreifen T-Lymphozyten sind positiv für CD1a, CD99 und TdT.