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Typisch für die bakterielle Vaginose ist der Nachweis von sogenannten Clue cells. Dabei handelt es sich um Plattenepithelien vom Intermediärzelltyp, die von dicht gepackten kurzen basophilen Stäbchen bedeckt werden. Dadurch erscheinen die Clue cells bereits in der Übersicht dunkelblau. Laktobazillus und Kokken können ein ähnliches Bild verursachen. Der zytologische Befund erlaubt lediglich die Verdachtsdiagnose. Für die definitive Diagnose einer Gardnerelleninfektion ist eine bakteriologische Kultur notwendig.